Το λήμμα παραθέτει τις πηγές του αόριστα, χωρίς παραπομπές.Βοηθήστε συνδέοντας το κείμενο με τις πηγές χρησιμοποιώντας παραπομπές, ώστε να είναι επαληθεύσιμο.
Η σήμανση τοποθετήθηκε στις 14/02/2020.
Το πρωτάθλημα υδατοσφαίρισης Α2 ανδρών της περιόδου 1988–89, ήταν το τρίτο που διεξήχθη από την καθιέρωση Α1-Α2 Εθνικής κατηγορίας, και συμμετείχαν οκτώ ομάδες. Το πρωτάθλημα διεξήχθη σε δύο γύρους (εντός-εκτός έδρας) με βαθμολογία 2-1-0.
Πρωταθλητής αναδείχθηκε ο Ν.Ο. Χανίων, που κέρδισε απευθείας την άνοδο για την Α1 της επόμενης περιόδου και επίσης συμμετείχε στα πλέι-οφ για το Πρωτάθλημα Ελλάδας. Δευτεραθλητής ήταν ο Ηλυσιακός Α.Ο. Αθηνών, που έδωσε αγώνες μπαράζ με τον 7ο της Α1 Ηρακλή Θεσσαλονίκης, για τη συμμετοχη της μιας ομάδας στα πλέι-οφ αλλά και στο πρωτάθλημα Α1 της περιόδου 1989-90.
Οι αγώνες μπαράζ διεξήχθησαν μεταξύ του 2ου της Α2 και του 7ου της Α1. Λειτούργησαν ταυτόχρονα ως αγώνες διαβάθμισης για την Α1 της επόμενης περιόδου (1989-90), και ως αγώνες πρόκρισης στην προημιτελική φάση των πλέι οφ 1988-89. Την πρώτη θέση κέρισε η ομάδα που έφτασε πρώτη τους 3 βαθμούς.